柯姓主源有两支，一支源起于河南，一支源起于浙江。

秦汉魏晋时，柯姓在济阳郡（今山东东明、河南兰考一带）、齐郡（治今山东淄博）、河南郡（治今河南洛阳）、钱塘县（治今浙江杭州）繁衍得格外兴旺，成为当地名门望族，并以此四地为主源，逐渐散居于河南、河北、山西、山东、安徽、江苏、浙江、江西等地。

后晋天福元年（942年），柯宝，自水沟巷分居莆阳；留居观西，下传五世，为泉州之望族。

明靖康之变后，柯姓家道衰微，不得已分散播迁。据福建济阳谱系记载，南宋时，有兄弟三人由河南济阳府固始县相率入闽，初居于福州下大风陈张勤乡，此后分姓分居，辟地开族。长兄入辛姓，三弟入蔡姓，分居惠安、泉州一带；次子则入柯姓，分支泉州东门外，后再分永春诗山一带。源自三千年前吴国公族的柯氏，初期蕃衍于故国所在地的江浙一带，然后，随着历史的演进，逐渐向四面八方发展，尤其在地利优越条件下，向南播迁的最多，所以成为南方各地，特别是福建省境内的一个名门望族。另一支先世居广信府贵溪县（今属江西）的柯姓，始祖曾任潮州太守，遇北宋金人之乱，乃隐于漳州府龙溪县二十五都都良村，支派分衍，遍及闽南。可见宋元乱世正是柯姓遍及江西、广西、广东、四川、湖南、湖北等南方诸多省份的重要原因。明以后，有柯姓移居台湾。

清康熙中期，柯姓三十六始祖柯增光由江西迁河南商城，子孙散居豫皖交界处。

当代，柯姓主要分布于中国的西南、西北、东北各地。